长江口二号古船考古试掘工作计划于2024年9月28日至2025年1月期间实施，发掘区布设4个探方，面积约为124平方米，深度约3米。考古试掘遵循从上至下、由晚至早的原则，以探方、船舱为基本工作单位，船体内外同时向下发掘。

　　上海市文物保护研究中心副主任 翟杨：我们在发掘完之后，要保证裸露的船体不变形不损坏，这是一个预期的难度。另外一个就是发掘、测绘，还有我们考古和保护这些工种之间的协调。

　　为了更好解决水下有机文物更为脆弱、环境更为复杂情况下的考古发掘和现场保护难题，在古船保存现场设计建造了3600多平方米的专用考古工作站，包括可开合智能保护舱、综合考古发掘平台、文物保护实验室三大模块。